SplitsTree4 é o principal aplicativo para computação enraizadas em redes filogenéticas em dados de sequências moleculares. A partir de um alinhamento de sequências, uma matriz de distância ou de um conjunto de árvores, o programa irá calcular uma árvore filogenética ou de rede usando métodos de decomposição.
Dentre os métodos estão neighbor-net, consensus network, super networks ou métodos de hibridização de computação ou de redes de recombinação simples. SplitsTree4 é escrito em Java e consiste em uma aplicação totalmente nova com muitos recursos .
