Modotate acrescenta um novo botão a cada janela que, quando pressionado, fará as janelas ganharem um efeito 3D. Assim, ele vai guardar as suas janelas "achatadas" perto da borda da tela, como parte de uma vidraça. Cada uma terá um guia para lhe dizer que é. Você ainda conta com a opção de modificar a transparência das janelas ainda no modo 3D.